丰富多彩的学生社团活动是学生校园生活的重要组成部分。学院鼓励学生积极自我组建各类有益的社团组织，旨在促进学生的身心健康发展和创新能力。为贯彻“培养适应社会进步和中医药发展事业需要，具有市场竞争力的实践型、创新型、创业型人才”的办学指导思想，不断加强和完善实践教学改革，培养学生实践操作的能力,全面提高实践教学质量,从而达到提高学生创新思维、独立分析和解决问题的能力，增强毕业生岗位适应能力和社会竞争能力，培养新世纪具有最佳智能结构的中医药人才。
2002年成立“福建中医学院耳针协会”至今，郑美凤教授长期担任协会的指导老师。协会成立以来始终坚持“推广耳针知识，服务社会”的宗旨，对我校内有一定中医理论基础的学生进行正规的技能培训及严格的考核，选拔。同时，耳针协会定期举办义诊活动，深入各大高校，社区，老人院等场所，开展讲座，义诊。普及了耳针疗法，提高了学生的技能。规范的义诊活动，受到了社会各界的好评。
2005年在前期耳针协会创建的基础上，成立了“华康针推青年志愿者协会”，这是一个全校性的学生学术活动社团，是我院学生理论联系实际，提高实践能力的一个大舞台，它覆盖面广，参与人数多，影响面大，深受学生和社会群众的欢迎。参加的学生主要是大三、大四年级的学生，他们均已经学习针灸的基础理论和通过了实践教学中技能操作的训练。多年来，同学们通过《针灸学》、《刺法灸法学》网络课程的学习，经过刺灸法操作技能实训和临床见习，对常用刺灸方法较为熟练以后，在专业教师指导下，利用所学知识，长期坚持开展社会服务，活动内容包括举办针灸保健学术讲座，积极开拓社区服务，进行社区义诊活动，长期坚持到养老院、残疾学校等公益机构进行义诊活动，利用所掌握专业知识和刺灸基本技能服务于社会。